胶水语言（python）的强大：从MultinetX 到 Muxviz绘图

hxy

No pains, no gains.

胶水语言（python）的强大：从MultinetX 到 Muxviz绘图

hxy 2019-11-26 16:15

最近写了一个转换工具，将一般常见的多层网络数据集进行简单的可视化，并转化为Muxviz实用的格式。代码如下：

# -*- coding: utf-8 -*-
'''
@Descripttion: 数据转换工具：从multinetx转化为 muxviz 的格式
@Version: 1.0
@Author: neuhxy
@Date: 2019-11-25 21:05:39
@LastEditors: neuhxy
@LastEditTime: 2019-11-26 16:08:26
'''
import multinetx as mx

name = 'mirna_multiedgelist'
ext = 'list'
filepath = './data/%s.%s'%(name, ext)
M = mx.read_multilayer_edges(filepath)
mx.convert_M_to_R(M, name=name)

这段代码就是从文本文件导入数据到 multinetx 对象，然后利用 comvert_M_to_R() 方法生成合适的数据集，然后需要将生成的文件夹拷贝到muxviz的data文件夹里，然后就可以画图了。看几个效果吧：